Appelé localement « Papangue », classé par l’UICN sur la Liste rouge des espèces menacées dans la catégorie « en danger », le Busard de Maillard (Circus maillardi) est l’un des busards les plus menacés au monde. Endémique de La Réunion, cet oiseau à faible effectif est le dernier rapace diurne nicheur sur l’île (le Faucon de Dubois - Falco duboisi- y est éteint depuis 1670).

L’Echenilleur de La Réunion est une des espèces d’oiseaux les plus menacées en France. C’est un passereau de taille moyenne d’une vingtaine de centimètres. Essentiellement insectivore, l’espèce peut également se nourrir de fruits ou de lézards. L’espèce est endémique de l’île de La Réunion et son aire de répartition se réduit à 11 km² dans les hauts des communes de Saint-Denis et de la Possession (Réunion). On y compte seulement 25 à 30 couples reproducteurs, une diminution de 25% du nombre de mâles chanteurs entre 1974 et 2005.

Plusieurs espèces d’arbres et d’arbustes vivent dans un même habitat le long de la côte ouest de l’île :
- le Latania lontaroides, palmier à tronc unique, non épineux, pouvant atteindre 12 m de haut ; espèce assez rare dans la nature mais anciennement et largement cultivée et exploitée par l'Homme rendant difficile l'interprétation des pieds isolés ou en masse que l'on peut rencontrer en milieu naturel.
- le Ruizia cordata, arbuste jusqu’à 10 m de haut, à port dressé et ramifié, à jeunes tiges couvertes d'une
pubescence blanchâtre. Rarissime à l’état naturel, la plante est cultivée en pépinière et présente dans de nombreux jardins.
- le Tabernaemontana persicariifolia, arbuste souvent ramifié dès la base, pouvant atteindre 3 m de haut, à latex blanc abon-
dant. L'arbuste peut éventuellement être confondu avec Tabernaemontana mauritiana, qui s’en distingue par des feuilles de dimensions plus importantes, une nervation secondaire plus fournie (environ 20 paires de nervures) et une zonation écologique
distincte (forêts humides de basse et moyenne altitude).

Dix espèces fortement menacées avec, pour une majorité d’entre elles, des effectifs très faibles estimés à moins de 50 individus répartis dans quelques populations souvent isolées : Bakerella hoyifolia, Claoxylon, Eulophie, Heterochaenia fragrans, Lobelia parva, Nesogenes orerensis, Oeceoclades versicolor, Persicaria poiretii,Ceodes lanceolata, Les 10 espèces du PNA sont fortement menacées avec pour une majorité d’entre elles des effectifs très faibles estimés à moins de 50 individus répartis dans quelques populations souvent isolées. Exceptées pour A. rousselii et C. lanceolata, les différentes espèces possèdent une distribution spatiale en zone cœur de Parc National.

Deux espèces endémiques de La Réunion, considérées respectivement en danger critique d’extinction et en danger d’extinction. La Euphorbia goliana, chaméphyte prostré à faible lignification des parties inférieures des tiges (Figure 4), à latex blanc, pouvant atteindre 20 cm de hauteur, à fort pivot racinaire ; peut être confondu avec Euphorbia reconciliationis mais s’en distingue par des
feuilles beaucoup plus petites ne dépassant pas 3 × 2 mm et des cyathes solitaires et terminaux. Et Euphorbia viridula , chaméphyte prostré à faible lignification des parties inférieures des tiges, à latex blanc, atteignant 20 cm de hauteur. Une plante plante pionnière et rudérale participant à la colonisation des ouvertures ou tonsures (créées par des perturbations) des pelouses littorales pérennes dominées par trois endémiques : Delosperma napiforme, Euphorbia viridula et Lobelia serpens sur les trottoirs littoraux basaltiques du sud.

Ils sont probablement les derniers reptiles indigènes de l’île. Ils figurent parmi les vertébrés les plus menacés du territoire. Leur déclin a probablement commencé dès l’installation humaine il y a plus de 350 ans.

Le gecko vert de Manapany est uniquement présent sur une fine bande littorale localisée dans le Sud de l’île (aire d’occupation d’environ 1,4 km²). Ce gecko compte une cinquantaine de petites populations isolées les unes des autres. Le gecko vert de Bourbon possède une aire de répartition d’environ 300 km² et occupe une importante diversité d’habitats naturels, vivant à la fois dans des milieux forestiers et dans des falaises rocheuses d’altitude.

L'île de La Réunion est la seule île au monde à abriter deux espèces de pétrels endémiques. Ces deux espèces, le Pétrel de Barau (Pterodroma baraui) et le Pétrel noir de Bourbon (Pseudobulweria aterrima), sont toutes les deux menacées d'extinction à moyen et court terme. Ces oiseaux marins ne reviennent à terre que pendant leur période de reproduction, où ils nichent au sol dans des terriers situés en falaises sur des pentes extrêmement difficiles d’accès.

Il existe actuellement 7 espèces de tortues marines appartenant à 2 familles distinctes. La famille des Cheloniidae est représentée par la tortue verte (Chelonia mydas), la tortue imbriquée (Eretmo-chelys imbricata), la tortue olivâtre (Lepidochelys oli-vacea), la tortue de Kemp (Lepidochelys kempii), la tortue caouanne (Caretta caretta) et la tortue à dos plat (Natator depressa). Ces 6 espèces ont une carapace osseuse recouverte d’écailles cornées à laquelle sont soudées la colonne vertébrale et les côtes. Le nombre d’écailles sur la dossière et la tête, qui diffère selon les espèces, est un critère d’identification. La famille des Dermochelyidae est représentée par une seule espèce : la tortue luth (Dermochelys coriacea). Elle se caractérise par une absence d’écaille à l’âge adulte, sa dossière étant formée d’une épaisse couche de graisse recouverte d’une fine couche de peau appelée « cuir ». 5 de ces espèces sont présentes dans le sud-ouest de l’océan Indien et la tortue verte et la tortue imbriquée s’y reproduisent fréquemment.